Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELLSQ9NRZ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HELLSQ9NRZ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms