Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUFT1Q9NNX1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUFT1Q9NNX1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms