Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAT1LQ9HCJ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAT1LQ9HCJ6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms