Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CWC22Q9HCG8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CWC22Q9HCG8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms