Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C11orf49Q9H6J7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C11orf49Q9H6J7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms