Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NACA2Q9H009 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms