Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM6Q9C030 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms