Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIOK2Q9BVS4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms