Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SHANK2-AS3Q9BTD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms