Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM79Q9BSE2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM79Q9BSE2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms