Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDF4Q9BRK5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDF4Q9BRK5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms