Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPOCK3Q9BQ16 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms