Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UIMC1Q96RL1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UIMC1Q96RL1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms