Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM47Q96LD4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM47Q96LD4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms