Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDK5RAP3Q96JB5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms