Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG3Q96JB2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms