Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX21Q969T3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX21Q969T3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms