Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms