Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTLL11Q8NHH1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms