Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms