Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms