Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPFIBP1Q86W92 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms