Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms