Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms