Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BBS12Q6ZW61 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BBS12Q6ZW61 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms