Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM43BQ6ZT52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM43BQ6ZT52 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms