Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LRRC9Q6ZRR7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
LRRC9Q6ZRR7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms