Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC73Q6ZRK6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms