Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms