Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf54Q6X4T0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms