Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BLOC1S2Q6QNY1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BLOC1S2Q6QNY1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BLOC1S2Q6QNY1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BLOC1S2Q6QNY1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BLOC1S2Q6QNY1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BLOC1S2Q6QNY1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms