Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMOD2Q6P5Q4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMOD2Q6P5Q4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms