Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EDC4Q6P2E9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EDC4Q6P2E9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms