Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRNP1Q6NT89 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms