Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCARA3Q6AZY7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCARA3Q6AZY7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms