Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG99

LYSMD4, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD4Q5XG99 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYSMD4Q5XG99 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LYSMD4Q5XG99 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms