Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC183Q5T5S1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC183Q5T5S1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms