Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD3Q5JV73 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD3Q5JV73 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms