Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSD17B12Q53GQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSD17B12Q53GQ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms