Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYTL3Q4VX76 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYTL3Q4VX76 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms