Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CERKLQ49MI3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CERKLQ49MI3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms