Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRRQ15256 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRRQ15256 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms