Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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