Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NCAPD2Q15021 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NCAPD2Q15021 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms