Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCA4Q14CN2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLCA4Q14CN2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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