Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CHD4Q14839 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
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