Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRCAPQ14761 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms