Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSPNQ14714 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSPNQ14714 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms