Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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GBX1Q14549 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX1Q14549 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBX1Q14549 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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