Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD9Q14511 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD9Q14511 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms